Le Parc naturel des Aiguamolls de l'Empordà (créé par la Loi 21/1983 du 28 octobre, sur la Protection des Aiguamolls de l'Empordà) a été déclaré zone protégée après une longue et intense campagne de défense qui avait débuté en 1976 pour tenter d'éviter l'urbanisation de la zone.

Trois zones principales constituent le parc proprement dit :

La Réserve des "Estanys":
Faite de grandes étendues de roselières, de massettes et de champs inondables.

La Réserve des "Llaunes" avec ses lagunes littorales, ses prés saumâtres et ses dunes.

La Réserve de " L'Illa de Caramany":
Située au milieu du cours de la rivière Fluvià, lieu de nidification de nombreux oiseaux.
La flore de cet espace protégé est principalement concentrée dans des parties à demi inondables ou inondées et, en ce sens, il convient de remarquer la présence de plantes typiques de ces milieux, comme c'est le cas des salicornes (Arthrocnemum, des sols salins), du roseau des sables (Ammophila arenaria) qui poussent sur les sables du bord de mer, et de l'iris jaune (Iris pseudacorus).

En dernier lieu, il ne faut pas oublier la présence fournie de la faune et il faut tout particulièrement citer la loutre eurasienne (Lutra lutra) et la cigogne blanche (Ciconia ciconia), espèces qui furent réintroduites avec succès il y a déjà quelques années, de l'épinoche à trois épines (Gasteosterus aculeatus) et de l'aphanius d'Espagne (Aphaniius iberus), deux poissons particulièrement caractéristiques de ces eaux et espèces endémiques de la zone.